マイントリンガーとマイナリングという2人の魔法使いの姉妹が住む世界、まいぜんシスターズの物語は、前編での戦いの後、ついに決着を迎えようとしていた。しかし、その最中に、マイントリンガーのペットであるマイッキーが突然誘拐されてしまう。
マイントリンガーはマイナリングと共に、マイッキーを助け出すために動き出す。彼女たちはまず、まいぜんシスターズの母親であり、魔法の女王でもあるママトリンガーに相談をし、マイッキーの行方を知るための魔法を使ってもらうことにする。
ママトリンガーの協力を得て、2人はマイッキーをさらった犯人の居場所をつきとめることに成功する。それは、魔法の森の奥深くにある、邪悪な魔法使いバッディングの城だった。バッディングはマイッキーを自分のペットとし、魔法の力を利用して自分の配下にしようとしていたのだ。
マイントリンガーとマイナリングは、バッディングの城に向かい、さまざまな魔法や罠を乗り越えて、マイッキーを救い出す。彼女たちはバッディングを打ち倒し、マイッキーを元の姿に戻すことに成功する。
しかし、そこでママトリンガーから衝撃的な事実を聞かされる。実は、バッディングはマイントリンガーの双子の弟であり、家族を捨てて魔法の力を求める道を選んだのだった。マイントリンガーは悲しみと衝撃に包まれるが、ママトリンガーはバッディングを許し、元の家族に戻そうとする。
こうして、マイントリンガーとマイナリングはマイッキーを取り戻し、家族の再会を果たす。そして、まいぜんシスターズの世界は再び平和になったのだった。
マイントリンガーとマイナリングの強い絆や家族の絆が物語を支え、最後まで感動的なストーリーが展開するまいぜんアニメ後編。魔法の世界で繰り広げられる冒険と家族愛の物語をぜひご覧いただきたい。
