『まいくら・マインクラフト1』とは、世界的に大人気のゲーム『マインクラフト』を題材とした漫画作品である。物語の舞台は、近未来のメガ都市である「まいくら市」。プレイヤーが主人公となり、他のプレイヤーたちと共に箱庭のように自由に創造しながら遊ぶゲーム『マインクラフト』。しかし、その遊びを楽しんでいたプレイヤーたちは、突如として現実世界とマインクラフト世界が融合した新時代の世界に飛ばされる。
そんな中、とあるプレイヤーである主人公は、突然『まいくら市』内で追われる身となってしまう。彼は逃げるようにマインクラフトの世界に飛び込み、自分のスキルを生かしてタイムリーに敵を退けながら逃走を続ける。マインクラフト内では、主人公の能力を表す「クラフト能力」が発現し、周囲のブロックを自由自在に操作して敵を振り切る。
しかし、逃亡中に主人公は『まいくら市』での現実とマインクラフト世界の謎を突き止めることになる。『まいくら市』では、ネット上での個人情報がすべて公開されていることや、マインクラフト内での大会で死んだプレイヤーが現実世界で死んでしまうことなどが明らかになっていく。
主人公は逃走しながらも、この新時代の世界に対する疑問や謎を追い求めていく。果たして彼は『まいくら市』での現実とマインクラフト世界の謎を解き明かすことができるのか。そして、彼は逃げ続けることなのか、それともこの新時代の世界に立ち向かうことなのか。それを描いた冒険活劇が、『まいくら・マインクラフト1』である。
